Борис Штерн — лауреат премии «Старт» за сборник «Чья планета?», был признан лучшим фантастом Европы (до него этой чести в Восточной Европе удостаивались лишь братья Стругацкие и Станислав Лем). В 1999 году на конгрессе фантастов России «Странник» писателю посмертно присуждена премия «Паладин фантастики».

С начала 1990-х годов Борис Штерн начинает больше печататься. Расширяется его жанровый диапазон — он обращается к сказкам, сатире, социальной и реалистической прозе. Одно из наиболее известных произведений того периода повесть «Записки динозавра», а также продолжение цикла рассказов о приключениях инспектора Бел Амора[3].

Выходят сборники Бориса Штерна «Кто там?», «Рыба любви» и другие. Издаётся роман «Эфиоп», который получает премию «Бронзовая Улитка». Однако в ноябре 1998 года он неожиданно умирает (как он сам писал в автобиографии, гадалка пророчила ему смерть в 2010 году). Роман про инспектора Бел Амора «Вперёд, конюшня!» вышел уже после смерти автора.

Один из рассказов Бориса Штерна "Дед Мороз", написанный в период сотрудничества автора с журналом "Химия и жизнь", в 1990 году вошел в состав сборника иронической фантастики "Перпендикулярный мир" от издательства "Наука".